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BSCW

Summer Term 2009

• Hauptseminar: Die Geschichte der Rechnerarchitektur

Summer Term 2008

• Hauptseminar: Virtualisierungstechniken

Summer Term 2006

• Hauptseminar: Geschichte der Rechnerarchitektur

Winter Term 2005/2006

• Bioinformatik - Anwendung und Nutzen in Biologie, Biotechnologie und Medizin, Lehrauftrag an der Universität der Bundeswehr München

Summer Term 2005

• Hauptseminar: Geschichte der Rechnerarchitektur

Summer Term 2004

• Hauptseminar: Geschichte der Rechnerarchitektur
• Hochleistungsarchitekturen (Notebook University: Cluster Programmierung mit Java

Summer Term 2003

• Hauptseminar: Geschichte der Rechnerarchitektur
• Hochleistungsarchitekturen (Notebook University: Cluster Programmierung mit Java)

Summer Term 2002

• Parallelrechner-Praktikum: Cluster Programmierung mit Java

Winter Term 2001/2002

• Tutorübung zur Vorlesung "Einführung in die Informatik III"

Doktoral Theses

• Dipl. Inf. Kai Bader. Entwicklung eines leistungsfähigen Computerverfahrens für Design und Evaluierung von diagnostischen DNA-Chips aus Genomsequenzdaten;
since 01.01.2008, Fakultät für Informatik, TU München.

• Dipl. Inform. Michael Ott. Parallelisierung von Algorithmen für die Maximum Likelihood basierte phylogenetische Analyse von molekularen Sequenzdaten auf hybriden Hochleistungsarchitekturen.
Supervision: Dr. Harald Meier, Dr. Alexandros Stamatakis;
since 01.01.2005, Fakultät für Informatik, TU München.

• Yadhu Kumar. Development and Integration of Structure Based Visualization Tools in ARB Software Package.
Supervision: Dr. Wolfgang Ludwig, Lehrstuhl für Mikrobiologie, TU München; Dr. Harald Meier;
finalised 01.12.2005 am WZW Weihenstephan, TU München.

• Dipl. Inf. Alexandros Stamatakis. Distributed and Parallel Algorithms and Systems for Inference of Huge Phylogenetic Trees based on the Maximum Likelihood Method;
finalised 20.10.2004, Fakultät für Informatik, TU München.

Diploma Theses

• Kai Bader. Computer-basierte Verfahren zur funktionellen Genomanalyse in der Bioinformatik;
finalised 15.12.05.

• Chris Hodges. Distributed data structures for efficient molecular sequence analysis.
Supervision: Dr. Harald Meier, Dr. Max Walter;
finalised 15.11.03.

• Markus Kräutner. ASSPERA - Entwicklung eines versionierenden Datenbankservers für molekulare Sequenzdaten mit Aufbereitungswerkzeugen, basierend auf CORBA;
finalised 15.09.03.

Bachelor Theses

• Robert Keiselt. Search indices for the distributed signature search in large genome databases and the cost benefit analysis regarding their suitability for the Biotech-Industry;
Supervision: Dr. Harald Meier, Dr. Gabriele Witterstein;
since 15.11.2008.

• Sebastian Huber. Hochperformante, auf einer relationalen Datenbank basierende Abstraktionsschicht zur Modellierung von versionierten Objekten;
finalised 15.08.03.

Interdisciplinary Internships

• Jürgen Huber. Development and testing of software tools for quality analysis of sequence data and alignments in ARB databases.
Supervision: Dr. Harald Meier, Dr. Wolfgang Ludwig, Dipl. Inf. Ralf Westram;
finalised 15.04.2004.

Advanced Internships

• Jörg Böhnel. Portierung des ARB-Softwarepakets auf 64-bit Architekturen und Evaluierung;
finalised 15.03.2008.

• Andreas Bombe. Genom-Auswertung mit programmierbarer Graphikhardware.
Supervision: Dr. Kipfer, Lehrstuhl für Computergrafik und Visualisierung, Fakultät für Informatik, TU München; Dr. Harald Meier;
finalised: 15.07.2005.

• Kai Bader. Development and implementation of an algorithm for deriving growth conditions for microorganisms from their molecular phylogeny;
finalised 15.12.04.

• Daniel Koitzsch, Christian Becker. Visualisierung von bakteriellen Genomen.
Supervision: Dr. Harald Meier; Dr. Kipfer, Lehrstuhl für Computergrafik und Visualisierung, Fakultät für Informatik, TU München;
finalised 15.09.04.

• Stefan Widmaier. Entwicklung und Implementierung eines JAVA-Klienten für den CORBA-basierten ASSPERA Server zur Anzeige, Verwaltung und Verarbeitung biologischen Daten;
finalised 31.05.04.

• Anja Thiele. Entwurf und Implementierung von CORBA-Diensten für ein verteiltes Bioinformatik-System;
finalised 15.08.03.

• Markus Kräutner, Andreas Krause. DNS-CHIP DESIGNER: Entwicklung einer Software für den Entwurf von DNS-Microarrays (DNS-Chips) aus Nukleinsäuredatenbanken;
finalised 30.10.02.

• Judith Hartmann, Stephan Tobias Dietl. SirplexSearchTool: Entwicklung eines Softwaresystems zur Suche und Spezifitätsevaluierung von siRNA-Sequenzen.
Supervision: Dr. Harald Meier; Dr. Roland Kreutzer, Dr. Peter Vornlocher, Ribopharma AG, Kulmbach (jetzt Roche-Kulmbach);
finalised 15.09.02.